단백질 입체구조 시뮬레이션

단백질 입체구조 시뮬레이션

계산하는 힘를 연구와사업을움직이는 힘로.

고지마 후미히사의사업분야의중에서, AI·계산과학는 Web3와블록체인, 의료·바이오테크을연결하는중요한 토대입니다.

학생 시절부터생명정보학, 바이오인포매틱스, 신약 개발 연구에관심을 갖고, Studio Makyu Co., Ltd.에서는 Web 제작와시스템 개발뿐만 아니라, GPGPU, HPC, In Silico 분석, 연구용 소프트웨어개발에도관여해 왔습니다.

현재의Biozipcode™관련사업당뇨병·난치성 질환연구의사업화에도, 이계산과학의경험이살려지고 있습니다.

이 페이지에서는, 고지마 후미히사이추진해 온AI 및 계산과학 비즈니스의 역사의료 연구 및 사업화와의 연결를 정리합니다.

AI 및 계산과학 비즈니스란.

단순한 시뮬레이션만이 아닙니다

AI 및 계산과학 비즈니스란, 단순히AI을사용하는이와와 고성능 컴퓨터을보유하는이와에서는있지 않습니다.

대량의 데이터를 분석합니다.
복잡한 현상을 계산으로 파악합니다.
연구 가설 수립을 지원합니다.
실험만으로는 보기 어려운 관계를 찾습니다.
사업에 필요한 시스템으로 구현합니다.

이러한일련의활동를 연구와 사업 현장에서 사용할 수 있는 형태에하는이와이, 저에게의계산과학 비즈니스입니다.

특히의료·바이오테크의분야에서는 유전자, 단백질, 세포, 질환, 약물 후보, 임상 데이터등, 많은 정보이복잡에관련되어 있습니다.사람의 눈만에서전체을파악하는이와는어렵고, 컴퓨터에 의한분석AI을사용한지원이 중요해집니다.

당시 계산생명화학 연구실의 데스크

당시 계산생명화학 연구실의 데스크

출발점은 바이오인포매틱스입니다

고지마 후미히사는 대학의학부생및대학원생의시대에는 리츠메이칸대학교 생명정보학부에서생명정보학을배웠습니다.

생명정보학생명과학와정보과학이겹치는분야입니다. 유전자와 단백질 등의 생명정보를 컴퓨터로 분석하고,질환의이해와신약 개발 연구에이어 나가는학문입니다.

학생 시절부터, 바이오인포매틱스, 신약 개발, 분석 소프트웨어, 데이터 처리에관심을 갖고 있었던이와이, 그 후의Studio Makyu Co., Ltd.에서의연구 지원Biozipcode™의사업화에이어지고 있습니다.

이분야에서는 연구자뿐만 아니라, 연구을지원하는기술자연구 성과을사업로연결하는인재도 중요합니다. 고지마 후미히사는 대학에 연구자로 남기보다는,연구을외부부터지원하는사업 측의입장을선택했습니다.

또한, 당시소속되어 있었던리츠메이칸대학교 정보이공학부 생명정보학과계산생명화학 연구실에서는 키쿠치 타케시 교수에많은 도움을 받았습니다.학생 시절에받은지도와경험는 그 후의바이오인포매틱스, 계산과학, 의료연구 지원에추진하는 데의큰 토대가 되고 있습니다.

전용 계산 소프트웨어 뱅크와 워크스테이션

전용 계산 소프트웨어 뱅크와 워크스테이션

Studio Makyu Co., Ltd.에서의기술지원

Studio Makyu Co., Ltd.Web 제작와Web 마케팅, 시스템 개발을 출발점으로 하는 회사입니다.

한편, 이 회사에서는 이른 단계부터,바이오인포매틱스와GPGPU를 활용한 계산에도 힘써 왔습니다.

시가의과대학과의 공동연구 지원에서는 In Vivo와In Vitro의실험뿐만 아니라, In Silico 연구개발의지원도수행해 왔습니다.구체적으로는, BLAST 등의 분석 도구의이용, 독자 소프트웨어의개발GPGPU을사용한대규모 계산 처리등이포함됩니다.

이같은지원는 겉으로 드러나기 어려운 일입니다.

논문의저자로서앞에 나서는보다도, 연구을진행하는위해의환경을정비하는.
계산을 실행할 수 있도록 하는 것.
데이터를 다루기 쉽게 하는 것.
연구 성과을사업에연결하는위해의구조을만드는.

Studio Makyu Co., Ltd.시대의이러한기술지원이, 나중에Biozipcode, Inc.의설립로 이어졌습니다.

AI·계산과학을사용하는이와.

GPGPU·HPC의경험

GPGPU는 이미지 처리에사용되는GPU를 과학 계산와대규모 처리에활용하는기술입니다.

고지마 후미히사는 바이오인포매틱스분야에서의GPGPU활용에관심을 갖고, 분석 처리와대규모 계산환경의구축에관여해 왔습니다.

이경험는 두 가지의방향에확장되었습니다.

하나는 의료·신약 개발·바이오인포매틱스분야에서의계산과학지원입니다.
다른 하나는 암호자산 마이닝사업입니다.

겉보기에는하는와 바이오 연구와마이닝는전혀 다른의분야에보입니다.그러나, 둘 다대량의계산 자원을사용하는와말하는의미에서는 기술적인토대에공통점이있습니다.

GPU를 어떻게 조달할 것인가.
전력과 냉각을 어떻게 설계할 것인가.
계산 환경을 어떻게 안정적으로 가동시킬 것인가.
처리를 어떻게 효율화할 것인가.
투자한 설비를 어떻게 사업으로 성립시킬 것인가.

이 경험은 AI·계산과학을 단순한 연구 기술이 아니라,현실의사업로서다루는위해의기초이 되고 있습니다.

AI를 사용하기 전에 필요한 것

AI라는 단어는 널리 사용되고 있지만, 의료나 연구 현장에서 실제로 활용하려면 AI 자체보다 먼저 필요한 것이 있습니다.

먼저,데이터가 정리되어 있을 것.
다음으로, 무엇을 분석하고 싶은지가 명확이어야 합니다.
그리고,분석 결과를 연구나 사업에 어떻게 사용할 것인지가 정해져 있어야 합니다.

고지마 후미히사가 중시하는 것은 AI를 화려하게 보이게 하는 것이 아니라,AI을사용할 수 있는 상태까지정보와업무을정비하는이와입니다.

연구데이터를 정리하는.
논문 및 특허 정보을정리하는.
세포와질환에 관한정보을구조화하는.
검사 데이터와임상 정보를 장기적으로 분석 가능한 형태로 정리해 두는 것입니다.
연구자, 의료기관, 사업회사가 사용할 수 있는 화면과 시스템에 구현해 넣는 것입니다.

AI·계산과학 비즈니스에서는 이“전처리”와“체계화”가 매우 중요해집니다.

Biozipcode™와의 연결

Biozipcode, Inc.의연구개발에서는 세포 표적화 기술“Biozipcode™”당뇨병 줄기세포바이오마커5-ALAHDAC 저해제당뇨병합병증암치료등 여러 테마가 관계되어 있습니다.

이러한 연구를 진행하려면 실험뿐만 아니라,방대한계산량을처리하는계산 장비와방법에 의한지원이 필요해집니다.

어떤 세포를 표적으로 할 것인가.
어떤 펩타이드 서열이 특정 세포에 결합하기 쉬운가.
어떤 질환에 응용 가능성이 있는가.
기존 논문이나 특허와 어떻게 관계되는가.
임상연구에서 어떤 지표를 봐야 하는가.

이러한질문에 대해, 바이오인포매틱스, In Silico 분석, AI, 데이터베이스화, 문헌 조사, 특허 조사를 조합해 지원해 나갈 수 있습니다.

고지마 후미히사의 AI·계산과학 비즈니스는 Biozipcode™의같은대학발연구보다구현하기 쉬운형태에하는위해의이면의기반에서도있습니다.

7자리 아미노산 서열과 계산과학

Biozipcode™의특징의하나에, 7자리의아미노산서열를 사용하여,특정 세포을구별하는라는 사고방식이 있습니다.

아미노산은 20종류가 있기 때문에 7개의 아미노산을 조합하면 이론상약 13억 가지의서열이존재합니다.

이중에서, 목표로 하는 세포나 조직에결합하기 쉬운서열을 찾아,치료와진단에응용하는에는 실험뿐만 아니라, 계산을 통한 선별과 데이터 정리이 중요해집니다.

모든 것을 실험만으로 시험하는 것은 현실적이지 않습니다.
후보를 좁히는 것.
데이터를 비교하는 것.
서열와세포의관계을정리하는.
유망 후보을연구자이검토하기 쉬운형태에하는.

이같은장면에서, 계산과학와AI의활용이기대됩니다.

신약 개발 및 진단 지원으로의 응용

AI·계산과학는 신약 개발뿐만 아니라, 진단와바이오마커개발에도 관여합니다.

당뇨병 연구에서는,혈당치뿐만 아니라, 당뇨병 줄기세포와비정상 세포 상태를 어떻게 검출할 것인지가 중요해집니다. 장기적으로는,혈액검사, 세포 분석, 바이오마커, 이미지 분석, 임상 데이터등을조합하면이와에서, 보다정밀도 높은진단와연구평가이가능해질 수 있습니다.

또한, 암치료와난치성 질환에서도 어떤 세포를 겨냥해야 하는지, 어떤 약제를 조합해야 하는지, 어떤 환자군에 적합한지를 고려할 때,계산과학의역할는커집니다.

AI·계산과학 비즈니스는 단독으로 완결하는사업에서는있지 않습니다.의료연구, 진단기술, 신약 개발, 임상시험, 제약회사와의연계지원하는기반로서기능합니다.

향후 전개

향후, AI·계산과학 비즈니스에서는 다음의같은분야을검토하고 있습니다.

  • 바이오인포매틱스분석지원
  • 펩타이드 서열와세포 표적화 기술의후보 탐색
  • 논문·특허·연구정보의데이터베이스화
  • 당뇨병 줄기세포와바이오마커정보의정리
  • 5-ALA, HDAC 저해제, 기존 약물 리포지셔닝 조사
  • 암·난치성 질환로의응용 가능성의탐색
  • 임상연구 데이터의 정리·시각화
  • 공동연구처·투자자대상자료의 정보 정리
  • KYC·AML·컴플라이언스조사 시스템와의연계
  • 해외 전개를 위한 다국어 정보 정리

이들은 모두 “AI로 무언가를 만든다”기보다는,연구와 사업을 앞으로 나아가게 하기 위한 계산 기반으로 포지셔닝됩니다.

본 페이지의 위치정립

본 페이지는 고지마 후미히사가 관여하는 AI·계산과학 비즈니스에 대해, 바이오인포매틱스, GPGPU, HPC, In Silico 분석, AI활용, 연구 지원, 사업화지원의관계을정리하는위해의페이지입니다.

이이에서기재하는내용는 특정의연구 성과, 의료 효과, 진단 정확도, 치료 효과을보장하는 것은 아닙니다.

의료연구와신약 개발로의응용에는 연구자, 의사, 제약회사, 규제 당국에 의한검증이필요합니다.

공개 정보목록.

사업 및 회사의 포지셔닝

관련 회사, 직책, 공동연구, 해외 법인, 주요 프로젝트를 목록으로 정리하고 있습니다.

공개 자료 및 참고 링크

회사 정보, 공동연구, 논문, 특허, 관련 사이트 등의 참고 링크를 게재하고 있습니다.

의료·투자 및 기타 면책 고지

의료 연구, 투자, 토큰, 5-ALA에 관한 유의사항을 정리하고 있습니다.

자주 묻는 질문

고지마 후미히사, Biozipcode™, GDT, 5-ALA, 해외 전개에 관한 질문을 정리하고 있습니다.

문의.

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